Branchiostoma lanceolatum

Организмы

Условия содержания:

Морская вода 18  о/oo
Температура – 20 оС
Постоянная аэрация, объем аквариума 5 л на 20-30 животных
Грунт – песок (с места обитания)
Питание — Psammodictyon panduriforme var. continua или Entomoneis paludosa (каждые 3 дня)

Основные результаты:

  • Разработаны протоколы диссоциации различных тканей: сенсорных структур, мышечных тканей, эндостиля, нервной трубки;
  • Проведены первые работы по секвенированию клеток (Single-cell RNA sequencing) сенсорных структур и нервной трубки;
  • Проведена фиксация живых клеток по методу 10x Genomics;
  • Проведена фиксация для 3D анализа конформации хромосом;
  • Проведена фиксация животных для дальнейшего транскриптомного анализа
  • Выделено 30 мг высокомолекулярной ДНК для NGS

Планы:

  • Секвенирование и аннотирование полного генома Branchiostoma lanceolatum
  • Получение транскриптомов каждой нервной клетки с последующей кластеризацией по типам.
  • Разработка протокола поэтапной диссоциации нервных клеток с целью захвата отдельных клеток — пигментированных нейронов — которые имеют наименьшую выживаемость в экспериментах и погибают в первую очередь.