Освоение методов пробоподготовки и выделения клеток у представителей различных типов животных для дальнейшего секвенирования транскриптомов единичных клеток по технологии 10x Genomics

Стажировки

Сотрудники:

м.н.с. Водясова Е.А.

н.с. Челебиева Э.С.

Руководитель стажировки:

Мороз Леонид Леонидович

Место:

Копенгаген, Университет Копенгагена

Время:

24 – 29 октября 2017 года

Цель:

Освоение методов пробоподготовки и выделения клеток у представителей различных типов животных для дальнейшего секвенирования транскриптомов единичных клеток по технологии 10x Genomics

Задачи:

  1. Разработать протоколы диссоциации различных тканей животных для дальнейшей работы на 10x Genomics
  2. Провести захват клеток на 10x Genomics с дальнейшим синтезом кДНК для следующих видов Trichoplax adhaerens (Placozoa), Cristatella mucedo (Bryozoa), Branchiostoma lanceolatum (Cephalochordata)

Заключение о стажировке:

Проведены первые работы по SingleCell на 10x Genomics с дальнейшим синтезом кДНК на следующих видах: Trichoplax adhaerens (линия H1) (Placozoa), Cristatella mucedo (Bryozoa), Branchiostoma lanceolatum (Cephalochordata). Получены навыки по разработке протоколов диссоциации клеток для последующей работы на 10x Genomics, диссекции различных тканей у Branchiostoma lanceolatum (Cephalochordata) и их подготовки для scRNA-seq.