Структура лаборатории

Мобильная лаборатория «Морской геномики»

На борту НИС «Профессор Водяницкий» создана специализированная мобильная лаборатория «Морской геномики». В настоящее время в лаборатории установлен бокс абактериальной воздушной среды, и бактерицидный рециркулятор воздуха, что позволяет обеспечить необходимый уровень стерильности при проведении молекулярно-генетических работ. Имеется холодильное и морозильное оборудование, в том числе низкотемпературный холодильник для хранения образцов при температуре до -86⁰С. Лаборатория также оснащена системой аквариумов и проточных столов, которые позволяют поддерживать в нативном состоянии выловленных животных для последующей фиксации или проведения экспериментов, проводить качественную фото- и видеосъемку объектов. В ближайшее время предполагается установить на борту экономичную систему очистки воды, способную обеспечить лабораторию дистиллированной и деионизированная водой. Кроме стационарного оборудования, в лаборатории возможно дополнительно разместить микроскопы, лабораторное оборудование для выделения нуклеиновых кислот и проведения молекулярно-генетических анализов.

Биоинформационно-вычислительный комплекс (БИВК)

Биоинформационно-вычислительный комплекс (БИВК)  используется для хранения, обработки и анализа геномных и транскриптомных данных, а также других данных, полученных в процессе выполнения научно-исследовательских работ по темам Лаборатории и из других открытых источников. БИВК представляет собой распределённый комплекс, организованный на базе локальной вычислительной сети лаборатории БиФГМО и включает:

  • сетевое оборудование коммутации, маршрутизации, проводной и беспроводной передачи данных;
  • оборудование, обеспечивающее бесперебойное питание;
  • стационарные и мобильные рабочие станции;
  • сервер приложений;
  • устройства печати, сканирования, фото/видео наблюдения и съёмки.

 

На сервере приложений размещаются программные ресурсы, связанные с:

  • обработкой и анализом геномных и транскриптомных данных;
  • обработкой и анализом изображений и видеоматериалов;
  • статистическим анализом.

Научно-образовательный центр «Геномики и биоинформатики»

  • Создан в структуре лаборатории для реализации образовательных программ различного уровня для профессиональной подготовки и популяризации научных знаний в области морской биологии и функциональной геномики.
  • В задачи центра входит организация и проведение лекционных и практических занятий в рамках утвержденных образовательных Программ с использованием оборудования Лаборатории и привлечением ее сотрудников к образовательному процессу.
  • Организация подготовки выпускных квалификационных работ бакалавров, диссертаций магистров и аспирантов
  • Проведение практических школ-семинаров в рамках молодежных конференций и симпозиумов
  • Проведение тематических экскурсий для школьников

Подробнее ...